东方医院筹建于1986年,于1999年12月12日正式开业，是北京中医药大学第二临床医学院，国家中医药管理局直管单位，首批国家中医临床研究基地，是一所特色明显、功能齐全、设备先进，集医疗、教学、科研、预防和健康咨询为一体的三级甲等中医医院，是直属教育部管理、进入国家“211工程”建设的北京中医药大学所属附属医院，北京市医疗保险定点医院。2011年6月，北京中医药大学东方医院正式接收北京二七机车厂医院，命名为北京中医药大学东方医院西院区(二七院区)。2015年5月25日东方医院正式签约大兴南院区，命名为北京中医药大学东方医院南院区（经开区院区）。医院现为一院三区：即东方医院方庄院区、东方医院西院区(二七院区)、东方医院南院区（经开区院区）。总占地面积5.68万平方米，总建筑面积12.43万平方米。
东方医院目前编制床位为1377张，其中：方庄院区开放编制800张(目前实际开放736张)；西院区编制床位375张；南院区编制床位202张，将逐步开放。医院现有高级专业技术人员305名；博士生导师31名、硕士生导师89名；享受政府特殊津贴专家4名；首都国医名师4名；国家中医药专家学术经验继承工作指导老师9名；北京市老中医药专家学术经验继承工作指导老师9名。医院设有临床、医技科室39个，采取以中医为主、中西医结合的诊疗模式。
东方医院现有国家卫健委临床重点专科6个，分别是脑病科、心血管科、妇科、肺病科、脾胃病科、护理学，同时是国家卫健委脑卒中筛查与防治基地、通过中国胸痛中心认证的国家胸痛中心。有国家中医药管理局重点专科项目14个，分别是脑病科、周围血管科、肾病科、心血管科、妇科、眼科、肺病科、脾胃病科、儿科、皮肤科、耳鼻喉科、肿瘤科、护理学、预防保健科(治未病中心)。是北京市卫健委第一批专科医联体的核心医院，牵头专业有脑病科、心血管科、呼吸热病科、妇科、儿科等5个。有北京市中医特色诊疗中心9个，分别是呼吸病中医特色诊疗中心、脑病中医特色诊疗中心、儿科中医特色诊疗中心、推拿科中医特色诊疗中心、肛肠科中医特色诊疗中心、耳鼻喉科中医特色诊疗中心、妇科中医特色诊疗中心、治未病中心、脾胃肝胆科中医特色诊疗中心；北京市中医药管理局重点专科5个，分别是针灸科、骨科、内分泌科、急诊科、临床药学；北京市中医药管理局“名中医身边工程”的牵头单位之一，组建名中医团队24个。拥有医师培训基地2个，分别是北京中医类别全科医生规范化培训基地、北京市中医住院医师规范化培训基地；另有北京市中医病案质控中心、北京市中医技术质控中心落户我院。
东方医院重视发展中医，特色鲜明，优势明显，对医疗实行精细化常态化管理。加强门诊建设，改善医疗服务，门诊实现微信预约、自助机预约、复诊预约、现场预约等多种预约就诊功能；实现了微信自助机缴费功能，为患者提供了方便，提升就医体验。医院注重绿色通道建设，开通了心、脑血管绿色通道，加强院内急救能力建设，着眼于提高解决疑难、复杂疾病的能力。为广大患者提供了及时有效、安全便捷、周到热情、技术精湛的医疗服务。
开院至今，医院开展了包括国家重点研发计划，国家杰出青年科学基金项目，“973”计划课题等在内的共1234项科学研究，其中主持国家级课题131项，省部级课题224项，获各级科技成果奖69项。现拥有国家中医药管理局细胞分子技术三级实验室，是国家食品药品监督管理局药物临床试验机构，并涵盖了15个新药临床试验专业。医院目前承担着国家教育部“211工程”三期重点学科建设项目，是国家中医药管理局重点研究室、北京市重点学科建设单位。中华中医药学会耳鼻喉科分会、中华中医药学会脉管病专业委员会、全国中医性学专业委员会及北京市等多个学术团体的主任委员或托管单位。医院设有国家级北京韦氏眼科流派传承工作室，国家级名医王沛教授、刘弼臣教授、周平安教授、陈淑长教授、庞鹤教授、金哲教授、刘大新教授、王素梅教授、韦企平教授名医传承工作室，北京市“薪火工程”名老中医杨甲三教授、刘弼臣教授、王永炎院士、韦玉英教授、王沛教授、周平安教授、廖家桢学术传承研究及工作室站。目前，我院中医学是国家教育部重点二级学科，其中包括中医内科学、中医外科学、中医妇科学、中医儿科学、中医骨伤科学、中医五官科学6个重点三级学科。“十一五”期间，国家中医药管理局批准我院为中西医结合临床、中医妇科学建设单位，“十二五”期间新增中医脑病学、中医痹病学、中医儿科学、中医耳鼻喉科学、中医眼科学、中医肛肠病学、中医周围血管病学7个重点学科。2012年我院被批准为国家中医药管理局标准研究推广基地，包括呼吸热病、耳鼻咽喉病、心血管病、脾胃病、风湿病、肿瘤、妇科等22个专业。
作为北京中医药大学第二临床医学院，具备完善的教学专业设置和层次结构，涵盖五年制、“5+3”
、留学生、硕士、博士、博士后、师承教育，为国家培养了一批高素质专门人才，是北京中医药大学优秀教学实践基地，北京市中医局临床技能实训基地，国家医师资格考试和考官培训基地。学院设有中医内科专业、中医外科专业、中医妇科专业、中医儿科专业、针灸推拿专业、中西医结合临床专业等11个研究生招生专业，建有中医学、中西医结合博士后流动站，现有博士学位授权点7个，硕士学位授权点11个，共设内、外、妇、儿等19个临床教研室，是北京中医药大学中西医结合内科学、中医眼科学、中医皮科学、中医肿瘤学、中医老年医学临床学系主任委员单位，全国中医药高等教育学会临床教育研究会的常务理事单位等。目前，学院承担北京中医药大学中医五年制、卓越中医学（5+3）和北京中医药大学--新加坡南洋理工大学“中医--生物双学位”项目班临床课课堂授课、见实习以及研究生教学等任务，也是北京中医药大学中药学院、针灸推拿学院、护理学院、管理学院、人文学院重要的实践教学基地。
医院建有现代化手术室、急诊EICU、内窥镜中心、肿瘤治疗中心、核医学科以及功能康复等设施，并拥有先进的诊断手段，配备如CT、核磁、DSA、彩超等大型医疗设备。
我院始终以“大医精诚、救死扶伤、患者至上”为宗旨，以“精益求精、诚信为本、弘扬国粹、传承创新”为理念，竭诚为广大患者服务。
